243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3390 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3390  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  40.86 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 		 393 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 396 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  39.39 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  38.07 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  40.66 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 401 aa  305  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 		 396 aa  305  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 396 aa  301  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  38.01 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4005  aromatic amino acid aminotransferase  36.99 
 
 		 396 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143022  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  35.7 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0028  aromatic amino acid aminotransferase  35.46 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5386  aromatic amino acid aminotransferase  36.73 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.409565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  37.47 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3509  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 396 aa  282  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  37.47 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  37.28 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  37.53 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  35.44 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  37.85 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  35.16 
 
 		 401 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  35.7 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 406 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  35.59 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  36.46 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0763  aromatic amino acid aminotransferase  36.87 
 
 		 401 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615005  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  35.44 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  35.16 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  35.81 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 394 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  36.46 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  34.94 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4224  aromatic amino acid aminotransferase  38.02 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  36.27 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  34.68 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  36.18 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  34.43 
 
 		 396 aa  259  9e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  34.18 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  33.92 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  34.43 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  34.43 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  33 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  34.94 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  34.94 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  36.02 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  34.68 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  33.42 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  33.42 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  34.09 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  32.15 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  34.68 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>