More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3114 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  78.84 
 
 		 399 aa  634    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  78.84 
 
 		 399 aa  634    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  75.44 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  61.77 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  48.98 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  47.46 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  48.73 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  48.73 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  48.73 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  48.73 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  47.72 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  46.84 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  47.72 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  47.46 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  47.37 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  47.62 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  46.19 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  46.19 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  46.45 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  47.46 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  46.19 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  45.57 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  44.16 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  44.42 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  48.34 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  48.58 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  46.7 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  43.83 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  46.45 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  45.43 
 
 		 397 aa  358  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  45.18 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  48.58 
 
 		 406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  44.42 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  46.85 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  45.43 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  45.94 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  48.06 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  45.18 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  45.69 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  45.06 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  43.65 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  46.62 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  45.18 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  43.69 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  45.61 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  45.59 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  44.16 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  44.42 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 396 aa  342  5e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 411 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  43.07 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  47.53 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  43.91 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  43.54 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  43.29 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 399 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  43.29 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  44.84 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3853  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  41.56 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>