More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0030 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
400 aa  823    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
400 aa  823    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  72.18 
 
 
400 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  69.5 
 
 
400 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  55.64 
 
 
398 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  58.61 
 
 
399 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  54.77 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  55.19 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  56.28 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  55.53 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  54.27 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  54.77 
 
 
398 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  54.02 
 
 
398 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  54.77 
 
 
398 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  56.53 
 
 
398 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  57.64 
 
 
398 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  56.53 
 
 
399 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  54.77 
 
 
398 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  54.27 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 
402 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  54.02 
 
 
398 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  55.28 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  53.02 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
398 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
398 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
398 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  52.26 
 
 
398 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
398 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
398 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
398 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  52.26 
 
 
398 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  51.37 
 
 
401 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  57.07 
 
 
399 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  56.81 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  51.51 
 
 
399 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
399 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  52.44 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  50.38 
 
 
399 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  48.62 
 
 
399 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  47.47 
 
 
397 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
397 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  48.37 
 
 
402 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
397 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
397 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  47.47 
 
 
397 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
397 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  48.12 
 
 
397 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  48.26 
 
 
399 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  49.25 
 
 
397 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  47.22 
 
 
397 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  47.22 
 
 
397 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  47.5 
 
 
401 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  47.22 
 
 
397 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  48.64 
 
 
399 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  45.86 
 
 
398 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
399 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  46.46 
 
 
397 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3763  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
397 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  48.11 
 
 
401 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  48.87 
 
 
397 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
396 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  47.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  46.21 
 
 
397 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  47.1 
 
 
405 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
396 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  47.24 
 
 
397 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
396 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  48.87 
 
 
398 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  46.97 
 
 
401 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
396 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>