28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01200 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01200  conserved hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  737    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03020  conserved hypothetical protein  48.73 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03040  conserved hypothetical protein  49.06 
 
 
385 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04770  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative  39.12 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00245  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05290)  39.31 
 
 
342 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02385  GPI anchored endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14360)  34.95 
 
 
626 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.517405  normal  0.442065 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03883  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02280)  35.28 
 
 
380 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38794  predicted protein  26.9 
 
 
541 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03820  hypothetical protein  31.18 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0522286  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03820  hypothetical protein  31.18 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.571814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.17 
 
 
819 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  41.82 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  39.39 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.57 
 
 
252 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.01 
 
 
1059 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 
752 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.03 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  27.27 
 
 
469 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  47.73 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  26.27 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.71 
 
 
815 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.85 
 
 
633 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.91 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 
423 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  29.11 
 
 
291 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  48.78 
 
 
409 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>