20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03200 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03200  protein phosphatase 2A regulatory B subunit, putative  100 
 
 
437 aa  914    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01545  hypothetical protein similar to protein phosphatase 2A regulatory B subunit (Broad)  70.49 
 
 
472 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541115  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65430  Protein phosphatase PP2A regulatory subunit B (PR55) (Cell division control protein 55)  59.19 
 
 
498 aa  587  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0029528  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86903  predicted protein  51.92 
 
 
513 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.98 
 
 
1599 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.57 
 
 
1211 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.71 
 
 
1557 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23 
 
 
1267 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  21.56 
 
 
1264 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
1363 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  21.56 
 
 
1264 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 
1240 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.75 
 
 
1236 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
1163 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.68 
 
 
1242 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1711 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.44 
 
 
1188 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.63 
 
 
1609 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 
1411 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.66 
 
 
833 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>