22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65430 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_65430  Protein phosphatase PP2A regulatory subunit B (PR55) (Cell division control protein 55)  100 
 
 
498 aa  1028    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0029528  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01545  hypothetical protein similar to protein phosphatase 2A regulatory B subunit (Broad)  60.69 
 
 
472 aa  617  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541115  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03200  protein phosphatase 2A regulatory B subunit, putative  59.19 
 
 
437 aa  587  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86903  predicted protein  50.36 
 
 
513 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0266579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.41 
 
 
1211 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1363 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 
1163 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.44 
 
 
792 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 
1236 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.47 
 
 
1491 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 
1711 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 
947 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.19 
 
 
657 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1267 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  21.8 
 
 
1443 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.28 
 
 
696 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.22 
 
 
1330 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.33 
 
 
1557 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  21.67 
 
 
728 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 
1789 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 
1686 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  29.22 
 
 
578 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>