More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0721 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1624  S-adenosylmethionine synthetase  78.84 
 
 
404 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0068  S-adenosylmethionine synthetase  81.91 
 
 
401 aa  679    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1103  S-adenosylmethionine synthetase  78.39 
 
 
402 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0703  S-adenosylmethionine synthetase  80.15 
 
 
399 aa  668    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1051  S-adenosylmethionine synthetase  75.82 
 
 
397 aa  638    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0721  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
398 aa  820    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429445  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1239  S-adenosylmethionine synthetase  74.81 
 
 
403 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1114  S-adenosylmethionine synthetase  74.56 
 
 
403 aa  627  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.701566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0626  S-adenosylmethionine synthetase  74.31 
 
 
398 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1476  S-adenosylmethionine synthetase  72.43 
 
 
399 aa  607  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.17298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  44.19 
 
 
381 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  44.61 
 
 
398 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  44.61 
 
 
398 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  45.02 
 
 
382 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
383 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0415  S-adenosylmethionine synthetase  46.23 
 
 
383 aa  293  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  44.47 
 
 
399 aa  293  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  44.78 
 
 
382 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  44.17 
 
 
403 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
384 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  45.39 
 
 
397 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  43.32 
 
 
383 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  43.18 
 
 
383 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  43.54 
 
 
382 aa  286  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  44.2 
 
 
388 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  43.9 
 
 
403 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  44.58 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  42.68 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  42.97 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  42.97 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  43.61 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  45.3 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  41.99 
 
 
402 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl240  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 
377 aa  280  3e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  44.36 
 
 
388 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  42.32 
 
 
384 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  42.62 
 
 
401 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 
385 aa  280  4e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  42.46 
 
 
384 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
395 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  42.11 
 
 
406 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
383 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
383 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
395 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
383 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
399 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  43.32 
 
 
393 aa  279  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  41.81 
 
 
383 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 
383 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  43.23 
 
 
418 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
384 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  43.6 
 
 
389 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  43.36 
 
 
385 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  42.05 
 
 
396 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  43.17 
 
 
395 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
383 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
383 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
383 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  42.61 
 
 
384 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  42.61 
 
 
384 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  42.61 
 
 
384 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
402 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  41.95 
 
 
396 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
399 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  41.5 
 
 
395 aa  275  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1727  S-adenosylmethionine synthetase  42.4 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  42.3 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  41.45 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  42.05 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  42.79 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  42.82 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>