More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1476 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1476  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 399 aa  822    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.17298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0068  S-adenosylmethionine synthetase  74.37 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1624  S-adenosylmethionine synthetase  74.62 
 
 		 404 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0703  S-adenosylmethionine synthetase  72.61 
 
 		 399 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0721  S-adenosylmethionine synthetase  72.43 
 
 		 398 aa  607  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1051  S-adenosylmethionine synthetase  71.11 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0626  S-adenosylmethionine synthetase  70.6 
 
 		 398 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1239  S-adenosylmethionine synthetase  70.6 
 
 		 403 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1103  S-adenosylmethionine synthetase  70.35 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1114  S-adenosylmethionine synthetase  70.35 
 
 		 403 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  43.56 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  44.9 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0415  S-adenosylmethionine synthetase  44.11 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  43.1 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  43.1 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  43.29 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  43.6 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  43.6 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  43.6 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  44.12 
 
 		 418 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  43.6 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  42.93 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  43.04 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  43.18 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1641  S-adenosylmethionine synthetase  43.2 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  43.1 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  42.04 
 
 		 383 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 		 383 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 		 383 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 		 383 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  42.55 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  41.67 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  42.54 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  41.67 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  42.79 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  42.49 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  43.34 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  42.72 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  42.12 
 
 		 388 aa  269  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  41.9 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  42.46 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  42.36 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  41.25 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  40.44 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  41.87 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1727  S-adenosylmethionine synthetase  42.12 
 
 		 384 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  42.12 
 
 		 388 aa  266  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  43.65 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  42.69 
 
 		 420 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  41.36 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  42.43 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  43.13 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0672  S-adenosylmethionine synthetase  42.65 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.017434  hitchhiker  0.00762172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  41.54 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  42.24 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  42.75 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  42.11 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  43.52 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1547  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  40 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  43.52 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  40.44 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0922  S-adenosylmethionine synthetase  41.5 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  41.48 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  41.85 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  42.93 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  42.93 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  40.39 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  40.73 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl240  S-adenosylmethionine synthetase  40.15 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  41.89 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  40.19 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>