More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0068 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1624  S-adenosylmethionine synthetase  79.2 
 
 
404 aa  657    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1239  S-adenosylmethionine synthetase  77.94 
 
 
403 aa  650    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1114  S-adenosylmethionine synthetase  77.69 
 
 
403 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.701566  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0068  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
401 aa  828    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1103  S-adenosylmethionine synthetase  78.3 
 
 
402 aa  652    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1051  S-adenosylmethionine synthetase  79.65 
 
 
397 aa  655    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0703  S-adenosylmethionine synthetase  90.73 
 
 
399 aa  758    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0721  S-adenosylmethionine synthetase  81.91 
 
 
398 aa  679    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0626  S-adenosylmethionine synthetase  77.19 
 
 
398 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1476  S-adenosylmethionine synthetase  74.37 
 
 
399 aa  629  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.17298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  43.72 
 
 
383 aa  306  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  43.64 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  44.7 
 
 
382 aa  301  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  45.57 
 
 
382 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  45.57 
 
 
382 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  43.72 
 
 
383 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
383 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  44.63 
 
 
403 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  44.15 
 
 
403 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  43.14 
 
 
384 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0415  S-adenosylmethionine synthetase  44.85 
 
 
383 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
383 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
383 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  41.85 
 
 
402 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  43.32 
 
 
383 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  43.32 
 
 
383 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  43.32 
 
 
383 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  43.22 
 
 
383 aa  293  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
383 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
383 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
383 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
383 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
383 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
398 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  42.57 
 
 
383 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  44.39 
 
 
397 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
398 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  43.83 
 
 
390 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  43.83 
 
 
390 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  42.64 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  44.13 
 
 
388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  43.61 
 
 
387 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  42.62 
 
 
397 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  44.37 
 
 
421 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  42.62 
 
 
396 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  43.69 
 
 
405 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  42.69 
 
 
399 aa  287  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  43.14 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  43.55 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
384 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  43.75 
 
 
388 aa  285  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  43.57 
 
 
418 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
395 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
395 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  43.37 
 
 
384 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
384 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
384 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
384 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  43.53 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  42.57 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  43.53 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  44.03 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  43.14 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  43.03 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0159  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  42.35 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  42.6 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  42.07 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  43.31 
 
 
395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  43.78 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  43.37 
 
 
395 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl240  S-adenosylmethionine synthetase  43.25 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  42.86 
 
 
420 aa  282  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  43.46 
 
 
396 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  43.8 
 
 
398 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  42.41 
 
 
395 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  41.65 
 
 
390 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  42.23 
 
 
402 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  43.26 
 
 
384 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>