171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05940 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.28 
 
 
741 aa  813    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.32 
 
 
768 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.94 
 
 
692 aa  678    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.77 
 
 
718 aa  676    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.07 
 
 
694 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  53.45 
 
 
698 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.1 
 
 
692 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.83 
 
 
744 aa  860    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.08 
 
 
919 aa  1026    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.68 
 
 
847 aa  1189    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05940  Inorganic H+ pyrophosphatase  100 
 
 
814 aa  1623    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.217127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.64 
 
 
671 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6198  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.68 
 
 
753 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  59.74 
 
 
890 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.62 
 
 
669 aa  633  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.5 
 
 
693 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.54 
 
 
672 aa  608  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.87 
 
 
672 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.93 
 
 
694 aa  601  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.62 
 
 
674 aa  595  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.96 
 
 
652 aa  588  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46 
 
 
705 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.3 
 
 
687 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.51 
 
 
653 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.63 
 
 
679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.49 
 
 
679 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.43 
 
 
700 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1428  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.57 
 
 
663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.53 
 
 
706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.41 
 
 
679 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.16 
 
 
674 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0992  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.6 
 
 
660 aa  548  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.701205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.75 
 
 
681 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.75 
 
 
681 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.62 
 
 
686 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.15 
 
 
688 aa  541  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.94 
 
 
689 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.33 
 
 
672 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.03 
 
 
712 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.38 
 
 
746 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.84 
 
 
712 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.21 
 
 
654 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.57 
 
 
679 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0486  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.77 
 
 
654 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000246606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.58 
 
 
682 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.25 
 
 
677 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.01 
 
 
712 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.57 
 
 
694 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.91 
 
 
700 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.83 
 
 
842 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.43 
 
 
694 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.65 
 
 
684 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.79 
 
 
711 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.92 
 
 
712 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15815  predicted protein  48.28 
 
 
644 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21183  predicted protein  43 
 
 
750 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.61 
 
 
694 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.51 
 
 
706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.7 
 
 
711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.01 
 
 
712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.18 
 
 
694 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.93 
 
 
706 aa  515  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.18 
 
 
681 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1826  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.99 
 
 
798 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.04 
 
 
681 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.25 
 
 
675 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.65 
 
 
684 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.38 
 
 
702 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.2 
 
 
680 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48479  H+-PPase family transporter: proton  44.05 
 
 
742 aa  511  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.4 
 
 
732 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.68 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.46 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1342  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.51 
 
 
649 aa  507  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.57 
 
 
697 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.92 
 
 
823 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.73 
 
 
687 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.25 
 
 
690 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.64 
 
 
712 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.33 
 
 
704 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.46 
 
 
682 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.12 
 
 
715 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.5 
 
 
704 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0774  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.42 
 
 
723 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.506706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.23 
 
 
680 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.39 
 
 
718 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.51 
 
 
671 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.88 
 
 
683 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.28 
 
 
717 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39838  H+-PPase family transporter: proton  43.8 
 
 
713 aa  499  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.11 
 
 
718 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44 
 
 
710 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44 
 
 
710 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.04 
 
 
707 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.98 
 
 
707 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.93 
 
 
706 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.39 
 
 
775 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1837  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.99 
 
 
712 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000332783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.58 
 
 
715 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.09 
 
 
706 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>