171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2413 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.27 
 
 
679 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05940  Inorganic H+ pyrophosphatase  53.45 
 
 
814 aa  682    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.217127  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.16 
 
 
741 aa  725    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  55.75 
 
 
687 aa  682    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.44 
 
 
674 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.61 
 
 
692 aa  996    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.57 
 
 
718 aa  1005    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.74 
 
 
672 aa  745    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  54.99 
 
 
654 aa  658    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.73 
 
 
672 aa  706    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.69 
 
 
692 aa  978    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.26 
 
 
694 aa  1014    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.96 
 
 
671 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.05 
 
 
694 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.16 
 
 
674 aa  696    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.69 
 
 
768 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1428  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.81 
 
 
663 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.89 
 
 
847 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.28 
 
 
679 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  51.27 
 
 
679 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6198  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.76 
 
 
753 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
698 aa  1368    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  57.85 
 
 
890 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.97 
 
 
919 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.12 
 
 
652 aa  700    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  62.34 
 
 
693 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.65 
 
 
653 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.93 
 
 
669 aa  719    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.69 
 
 
706 aa  653    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.48 
 
 
705 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.46 
 
 
744 aa  752    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.42 
 
 
700 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.52 
 
 
694 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0992  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.44 
 
 
660 aa  622  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.701205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0486  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.65 
 
 
654 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000246606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.72 
 
 
672 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.29 
 
 
746 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15815  predicted protein  53.38 
 
 
644 aa  600  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.36 
 
 
671 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.97 
 
 
677 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0774  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.53 
 
 
723 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.506706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.44 
 
 
681 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.44 
 
 
681 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.22 
 
 
684 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.22 
 
 
694 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.43 
 
 
686 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1342  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.97 
 
 
649 aa  589  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.79 
 
 
842 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.07 
 
 
694 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.78 
 
 
679 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.81 
 
 
682 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.36 
 
 
689 aa  588  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.38 
 
 
711 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.36 
 
 
681 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0751  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.25 
 
 
723 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0825148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1032  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.9 
 
 
724 aa  580  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.190901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.71 
 
 
688 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.07 
 
 
680 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.11 
 
 
706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.9 
 
 
690 aa  572  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.8 
 
 
684 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.4 
 
 
712 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.42 
 
 
700 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1837  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.19 
 
 
712 aa  570  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000332783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.81 
 
 
715 aa  568  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.14 
 
 
732 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.27 
 
 
681 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48479  H+-PPase family transporter: proton  47.63 
 
 
742 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.99 
 
 
712 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.41 
 
 
711 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.29 
 
 
682 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50 
 
 
680 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.72 
 
 
706 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1826  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.34 
 
 
798 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.43 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.29 
 
 
683 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.01 
 
 
710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.01 
 
 
710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.55 
 
 
706 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.99 
 
 
704 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.93 
 
 
712 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.87 
 
 
712 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.94 
 
 
715 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.58 
 
 
680 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.72 
 
 
675 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.4 
 
 
694 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.04 
 
 
707 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.32 
 
 
697 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.11 
 
 
704 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.31 
 
 
687 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.89 
 
 
702 aa  551  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.52 
 
 
707 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.15 
 
 
706 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.05 
 
 
742 aa  549  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.123755  normal  0.225048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.15 
 
 
686 aa  549  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.29 
 
 
712 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.45 
 
 
710 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.1 
 
 
706 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21183  predicted protein  45.98 
 
 
750 aa  547  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.38 
 
 
683 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0230915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>