47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0686 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0686  PIN domain-containing protein  100 
 
 		 47 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0660129  normal  0.756784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  80.85 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  57.45 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  59.57 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  53.19 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  51.06 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  51.06 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  51.06 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  51.06 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  46.81 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  48.94 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  46.81 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  44.68 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  46.81 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  48.94 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  46.81 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  46.81 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  42.55 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  46.81 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  44.68 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  44.68 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  40.43 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  45.65 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  41.3 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  43.48 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  42.55 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  42.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  36.17 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  40.43 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  45.65 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  42.55 
 
 		 140 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  38.3 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  38.3 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  40.43 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  42.55 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  37.78 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>