More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1581 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  56.93 
 
 
650 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_003296  RS02034  hypothetical protein  78.04 
 
 
641 aa  969    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  56.55 
 
 
669 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0475  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  56.16 
 
 
654 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4818  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.35 
 
 
641 aa  1010    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  56.76 
 
 
650 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5204  hypothetical protein  78.19 
 
 
641 aa  1007    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1975  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2111  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  56.02 
 
 
649 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  77.73 
 
 
641 aa  1003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0744  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  78.66 
 
 
641 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1864  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  963    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  78.35 
 
 
641 aa  988    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1581  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1290    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370419  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5067  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  97.65 
 
 
637 aa  1237    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.010013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  56.87 
 
 
653 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3287  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  78.04 
 
 
641 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5018  hypothetical protein  78.35 
 
 
641 aa  1007    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646307  normal  0.216934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  57.1 
 
 
650 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4493  hypothetical protein  78.35 
 
 
641 aa  1008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  55.1 
 
 
653 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5081  hypothetical protein  78.04 
 
 
641 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615505  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  82.81 
 
 
639 aa  1056    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  56.59 
 
 
650 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  56 
 
 
658 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0706  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  58.87 
 
 
632 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0832  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1002  iron-sulfur cluster binding protein  78.97 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  52.26 
 
 
661 aa  628  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0991  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  53.14 
 
 
670 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.996446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  51.24 
 
 
641 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.49 
 
 
629 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4040  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.79 
 
 
633 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206546  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  51.42 
 
 
633 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  50.85 
 
 
631 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.31 
 
 
632 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  50 
 
 
615 aa  525  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  40.41 
 
 
716 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  33.69 
 
 
678 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.53 
 
 
699 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  40.5 
 
 
718 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  40.35 
 
 
732 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.48 
 
 
694 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  37.76 
 
 
727 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.55 
 
 
762 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.54 
 
 
737 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.29 
 
 
694 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  38.62 
 
 
1033 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.71 
 
 
717 aa  293  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  36.65 
 
 
730 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  32.19 
 
 
752 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  38.29 
 
 
1388 aa  291  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.1 
 
 
686 aa  290  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.76 
 
 
713 aa  286  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  32.76 
 
 
699 aa  286  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.2 
 
 
683 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  36.96 
 
 
762 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  39.53 
 
 
727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  38.19 
 
 
678 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.16 
 
 
676 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.23 
 
 
737 aa  283  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.91 
 
 
698 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.59 
 
 
699 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.3 
 
 
722 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.23 
 
 
748 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  35.48 
 
 
739 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  33.46 
 
 
716 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  32.83 
 
 
703 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  35.1 
 
 
1044 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.58 
 
 
743 aa  281  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
703 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  36.71 
 
 
629 aa  280  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  32.38 
 
 
703 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  32.32 
 
 
703 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.28 
 
 
712 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  36.42 
 
 
882 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.15 
 
 
721 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  34.45 
 
 
1027 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  38.22 
 
 
683 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.41 
 
 
711 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.19 
 
 
1046 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  36.19 
 
 
1046 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.18 
 
 
711 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  36.19 
 
 
1042 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.62 
 
 
758 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  36.95 
 
 
711 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  35.27 
 
 
714 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  36.59 
 
 
720 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.18 
 
 
1131 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  33.99 
 
 
683 aa  262  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  34.91 
 
 
661 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>