37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1004 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  90.97 
 
 		 155 aa  286  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  75.48 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  74.19 
 
 		 155 aa  226  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  74.19 
 
 		 178 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  73.55 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  74.19 
 
 		 155 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  73.55 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  73.55 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  73.55 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  73.55 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  73.55 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  72.26 
 
 		 178 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  71.61 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  71.61 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  71.61 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  72.9 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  76.76 
 
 		 178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  55.26 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  58.11 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  53.29 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  53.29 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  54.73 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  43.15 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  42.03 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  39.73 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  38.93 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  38.56 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  36.31 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>