36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1688 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  81.58 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  68.71 
 
 		 148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  64.63 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  65.31 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  61.9 
 
 		 153 aa  180  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  65.31 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  65.31 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  60.81 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  51.77 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  55.03 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  39.73 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  40.4 
 
 		 177 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  38.16 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  42.47 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  37.33 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  41.78 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  94  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  36 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  39.73 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  39.73 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  36.09 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>