36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1287 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  82.43 
 
 		 148 aa  254  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  42.18 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  41.5 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  43.84 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  44.52 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  43.84 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  43.15 
 
 		 178 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  40.41 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  37.41 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  42.47 
 
 		 192 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  41.78 
 
 		 177 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  41.78 
 
 		 177 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  41.78 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  32.43 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  30.53 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  30.61 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  30.61 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  31.08 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>