36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0871 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  96.69 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  85.43 
 
 		 151 aa  269  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  59.6 
 
 		 164 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  61.38 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  54.67 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  53.29 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  53.29 
 
 		 155 aa  167  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  57.64 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  57.64 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  56.94 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  56.94 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  56.94 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  56.25 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  56 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  55.33 
 
 		 155 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  57.04 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  54.67 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  46.94 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  42.18 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  42.03 
 
 		 161 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  36.24 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  36.6 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  93.6  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  35.57 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  35.33 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  40.56 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>