36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1882 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  85.71 
 
 
148 aa  249  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  85.71 
 
 
148 aa  249  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  77.18 
 
 
168 aa  241  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  71.9 
 
 
153 aa  229  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  71.43 
 
 
148 aa  228  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  70.75 
 
 
148 aa  223  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  62.59 
 
 
152 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  61.9 
 
 
152 aa  180  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  54.29 
 
 
161 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  53.06 
 
 
146 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  40.4 
 
 
163 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  40.94 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  41.33 
 
 
155 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  42 
 
 
192 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  40.67 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  40.67 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  39.6 
 
 
177 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  39.6 
 
 
155 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  39.6 
 
 
155 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  39.6 
 
 
155 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  40.27 
 
 
178 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  40.69 
 
 
178 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  39.6 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  40.27 
 
 
178 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  38 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  36.24 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  35.57 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  31.97 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  31.29 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>