36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0943 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  356  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  98.71 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  92.9 
 
 		 155 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  92.9 
 
 		 155 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  92.9 
 
 		 155 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  88.76 
 
 		 178 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  79.78 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  79.78 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  82.32 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  71.91 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  76.77 
 
 		 155 aa  248  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  85.81 
 
 		 155 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  85.16 
 
 		 155 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  85.16 
 
 		 155 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  85.16 
 
 		 155 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  85.16 
 
 		 155 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  74.19 
 
 		 155 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  60.13 
 
 		 164 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  56.86 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  57.24 
 
 		 151 aa  168  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  57.64 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  56.94 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  44.52 
 
 		 148 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  43.84 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  40.27 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  40.27 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  42.47 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  48.97 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  40.41 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  39.6 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>