36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1471 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  79.05 
 
 		 148 aa  246  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  73.65 
 
 		 153 aa  231  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  75 
 
 		 148 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  75 
 
 		 148 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  70.75 
 
 		 153 aa  223  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  67.35 
 
 		 168 aa  207  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  68.71 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  65.31 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  47.86 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  53.74 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  39.46 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  39.87 
 
 		 177 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  38.56 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  36.6 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  35.95 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  39.6 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  39.47 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  39.47 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  39.47 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  39.47 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  39.6 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  40.14 
 
 		 178 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  37.16 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  37.16 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  37.16 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  37.16 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  37.16 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  37.41 
 
 		 177 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  37.41 
 
 		 177 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  37.16 
 
 		 192 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  29.53 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>