36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2861 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2861  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  304  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.307642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  99.35 
 
 
177 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0225  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.546326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2922  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0922  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2548  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  99.35 
 
 
177 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  98.06 
 
 
192 aa  297  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0588  hypothetical protein  85.16 
 
 
155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1067  hypothetical protein  85.16 
 
 
155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0851612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1026  hypothetical protein  85.16 
 
 
155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0947  hypothetical protein  85.81 
 
 
155 aa  248  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0943  hypothetical protein  85.81 
 
 
178 aa  247  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4181  hypothetical protein  85.16 
 
 
178 aa  247  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0768  hypothetical protein  78.71 
 
 
177 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2979  hypothetical protein  75.48 
 
 
155 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  74.19 
 
 
155 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2236  hypothetical protein  86.62 
 
 
178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2543  TM2  59.35 
 
 
164 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0929  hypothetical protein  58 
 
 
151 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0989192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  59.59 
 
 
163 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0800  putative transmembrane protein  56 
 
 
151 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0871  hypothetical protein  55.33 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228797  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0679  hypothetical protein  46.38 
 
 
161 aa  120  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0515  putative transmembrane protein  44.52 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1882  hypothetical protein  41.33 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1459  hypothetical protein  41.78 
 
 
152 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5347  hypothetical protein  38.93 
 
 
168 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1287  putative transmembrane protein  41.78 
 
 
148 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.22951  normal  0.293461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3357  hypothetical protein  40.14 
 
 
148 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2705  hypothetical protein  40.14 
 
 
148 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1400  hypothetical protein  38.51 
 
 
148 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3937  hypothetical protein  37.33 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.509127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1102  hypothetical protein  46.53 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1688  hypothetical protein  39.73 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1471  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>