70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0275 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  100 
 
 
477 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  93.92 
 
 
476 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  63.79 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  63.8 
 
 
477 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  63.14 
 
 
477 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  61.91 
 
 
459 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  62.55 
 
 
473 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  62.55 
 
 
473 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  63.19 
 
 
477 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  63.46 
 
 
457 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  61.97 
 
 
457 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  61.97 
 
 
461 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  37.31 
 
 
448 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  36.23 
 
 
436 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  34.39 
 
 
532 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  34.62 
 
 
531 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  34.59 
 
 
531 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  40.22 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  40.22 
 
 
532 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  38.73 
 
 
532 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  38.84 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  38.84 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  38.84 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  37.53 
 
 
532 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  37.53 
 
 
532 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  38.2 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  38.2 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  38.2 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  38.2 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  31.4 
 
 
417 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  31.4 
 
 
417 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  31.4 
 
 
417 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  33.03 
 
 
414 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  30.4 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  31.56 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  30.99 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  31.21 
 
 
467 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  32.79 
 
 
414 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  31 
 
 
417 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  31 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  30.79 
 
 
417 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  30.79 
 
 
417 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  32.55 
 
 
403 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  30.38 
 
 
417 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  30.07 
 
 
417 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  30.38 
 
 
417 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  29.65 
 
 
417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  32.4 
 
 
413 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  31.6 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  32.4 
 
 
413 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  32.26 
 
 
413 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  32.04 
 
 
413 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  30.52 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  31.82 
 
 
416 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  30.98 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  30.32 
 
 
428 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  32.27 
 
 
416 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  30.16 
 
 
429 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>