70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0240 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  87.06 
 
 
473 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  98.74 
 
 
477 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  85.68 
 
 
461 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  74.15 
 
 
459 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  90.79 
 
 
477 aa  863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  74.51 
 
 
457 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  87.27 
 
 
473 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  74.41 
 
 
457 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  89.33 
 
 
473 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  64.21 
 
 
477 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  64.08 
 
 
476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  39.14 
 
 
436 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  39.31 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  42.98 
 
 
532 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  42.7 
 
 
532 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  42.42 
 
 
532 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  41.99 
 
 
532 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  41.99 
 
 
532 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  41.71 
 
 
532 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  36.35 
 
 
532 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  36.35 
 
 
532 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  36.22 
 
 
532 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  36.15 
 
 
532 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  36.15 
 
 
532 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  36.15 
 
 
532 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  34.53 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  34.53 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  34.53 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  40.26 
 
 
531 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  39.59 
 
 
531 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  33.06 
 
 
417 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  35.96 
 
 
532 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  33.19 
 
 
467 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  32.99 
 
 
417 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  32.64 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  33.63 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  32.78 
 
 
417 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  34.03 
 
 
414 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  32.57 
 
 
417 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  32.57 
 
 
417 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  33.86 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  32.36 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  33.87 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  32.36 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  32.26 
 
 
428 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  33.41 
 
 
417 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  33.33 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  33.93 
 
 
413 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  33.48 
 
 
413 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  33.79 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  33.79 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  33.79 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  33.79 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  32.6 
 
 
413 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  32.21 
 
 
403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  33.56 
 
 
416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  33.56 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  33.56 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  32.37 
 
 
413 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  32.37 
 
 
413 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  33.11 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  32.25 
 
 
429 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>