70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3681 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  93.92 
 
 
477 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  100 
 
 
476 aa  940    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  63.71 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  64.91 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  63.66 
 
 
473 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  63.66 
 
 
473 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  62.47 
 
 
459 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  62.53 
 
 
457 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  63.21 
 
 
477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  63.06 
 
 
477 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  62.65 
 
 
477 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  62.74 
 
 
461 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  37.17 
 
 
448 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  40.44 
 
 
532 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  40.33 
 
 
532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  41.23 
 
 
532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  35.32 
 
 
436 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  38.02 
 
 
531 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  38.36 
 
 
531 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  38.44 
 
 
532 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  38.44 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  38.44 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  39.24 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  39.19 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  39.19 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  38.92 
 
 
532 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  38.92 
 
 
532 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  38.92 
 
 
532 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  38.92 
 
 
532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  33.03 
 
 
414 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  29.71 
 
 
419 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  32.56 
 
 
414 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  30.67 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  30.67 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  30.67 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  31.2 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  31 
 
 
467 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  30.93 
 
 
417 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  30.93 
 
 
417 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  30.38 
 
 
417 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  31.63 
 
 
403 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  30.72 
 
 
417 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  30.72 
 
 
417 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  30.32 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  30.32 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  31.63 
 
 
413 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  29.33 
 
 
417 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  32.18 
 
 
413 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  32.18 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  30.68 
 
 
419 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  31.03 
 
 
413 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  31.03 
 
 
413 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  31.57 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  32.76 
 
 
428 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  28.7 
 
 
417 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  30.46 
 
 
415 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  30.58 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  31.08 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>