70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2419 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  67.95 
 
 
532 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  65.52 
 
 
532 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  67.95 
 
 
532 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  68.52 
 
 
532 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  67.95 
 
 
532 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  65.52 
 
 
532 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  67.55 
 
 
532 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  67.95 
 
 
532 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  67.95 
 
 
532 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  69.6 
 
 
532 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  65.33 
 
 
532 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  97.55 
 
 
531 aa  1019    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1068    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  68.14 
 
 
532 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  68.14 
 
 
532 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  41.4 
 
 
436 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  44.04 
 
 
448 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  34.62 
 
 
477 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  35.18 
 
 
473 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  35.06 
 
 
473 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  41.19 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  34.23 
 
 
477 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  34.82 
 
 
417 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  38.02 
 
 
476 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  34.35 
 
 
477 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  35.24 
 
 
461 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  35.07 
 
 
457 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  39.59 
 
 
477 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  35.33 
 
 
459 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  35.33 
 
 
457 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  35.02 
 
 
417 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  35.02 
 
 
417 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  33.21 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  33.71 
 
 
417 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  32.9 
 
 
417 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  33.71 
 
 
417 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  33.52 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  33.52 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  32.76 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  32.76 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  34.05 
 
 
417 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  33.85 
 
 
417 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  33.85 
 
 
417 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  31.48 
 
 
416 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  31.48 
 
 
416 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  38.1 
 
 
414 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  31.48 
 
 
416 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  38.39 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  32.59 
 
 
419 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  30.37 
 
 
416 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  31.3 
 
 
416 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  31.3 
 
 
416 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  31.3 
 
 
416 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  31.3 
 
 
416 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  32.6 
 
 
413 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  33.95 
 
 
419 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  32.8 
 
 
413 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  31.99 
 
 
413 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  38.55 
 
 
428 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  36.22 
 
 
403 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  31.19 
 
 
415 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  37.25 
 
 
413 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  37.25 
 
 
413 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  32.32 
 
 
429 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>