70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2418 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  76.37 
 
 
417 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  76.37 
 
 
417 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  75.89 
 
 
417 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  76.37 
 
 
417 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  76.85 
 
 
417 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  100 
 
 
419 aa  847    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  76.37 
 
 
417 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  76.61 
 
 
467 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  98.09 
 
 
419 aa  835    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  76.61 
 
 
417 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  73.75 
 
 
417 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  73.75 
 
 
417 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  73.99 
 
 
417 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  73.03 
 
 
417 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  73.03 
 
 
417 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  72.79 
 
 
417 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  60.38 
 
 
414 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  61.46 
 
 
414 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  58.55 
 
 
416 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  59.36 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  59.11 
 
 
413 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  57.91 
 
 
403 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  58.87 
 
 
413 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  58.37 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  58.37 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  56.67 
 
 
416 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  57.11 
 
 
415 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  55.81 
 
 
429 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  54.8 
 
 
428 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  39.04 
 
 
436 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  39.61 
 
 
448 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  32.9 
 
 
532 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  32.17 
 
 
477 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  34.9 
 
 
477 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  32.1 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  34.68 
 
 
477 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  33.63 
 
 
461 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  32.85 
 
 
473 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  32.85 
 
 
473 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  31.92 
 
 
532 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  32.91 
 
 
459 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  32.91 
 
 
457 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  32.1 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  32.1 
 
 
532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  32.1 
 
 
532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  34.98 
 
 
532 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  34.11 
 
 
457 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  35.25 
 
 
532 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  35.04 
 
 
532 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  35.04 
 
 
532 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  34.84 
 
 
532 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  34.84 
 
 
532 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  34.84 
 
 
532 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  33.52 
 
 
531 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  29.79 
 
 
477 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  32.77 
 
 
531 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  29.71 
 
 
476 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>