70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3593 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  875    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  57.4 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  39.29 
 
 		 477 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  39.15 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  38.84 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  39.19 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  39.19 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  40.29 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  40.29 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  40.29 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  40.19 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  39.46 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  44.87 
 
 		 532 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  44.87 
 
 		 532 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  44.87 
 
 		 532 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  39.04 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  39.01 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  39.04 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  39.22 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  38.97 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  38.85 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  38.35 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  39.8 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  43.57 
 
 		 532 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  41.55 
 
 		 531 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  43.86 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  38.24 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  38.73 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  43.86 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  38.24 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  45.45 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  38.16 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  39.04 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  40.48 
 
 		 531 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  38.07 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  37.84 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  37.84 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 417 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  37.36 
 
 		 417 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  44.85 
 
 		 532 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  37.65 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  37.65 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  44.85 
 
 		 532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  37.65 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  37.65 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  44.55 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  44.55 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  44.55 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  36.74 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  44.24 
 
 		 532 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  37.28 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  37.39 
 
 		 417 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  35.96 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  33.78 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  33.26 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  33.26 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>