70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5177 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  99.76 
 
 
417 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  82.97 
 
 
417 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  82.97 
 
 
417 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  82.73 
 
 
417 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  82.73 
 
 
417 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  82.73 
 
 
417 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  99.76 
 
 
417 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  96.64 
 
 
417 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  836    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  82.25 
 
 
417 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  95.68 
 
 
417 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  95.44 
 
 
417 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  82.73 
 
 
417 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  82.73 
 
 
467 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  73.75 
 
 
419 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  73.99 
 
 
419 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  60.35 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  61.48 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  60.35 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  60.44 
 
 
403 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  60.69 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  60.69 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  59.95 
 
 
413 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  58.16 
 
 
416 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  60.2 
 
 
413 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  58.16 
 
 
416 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  58.16 
 
 
416 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  57.92 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  57.92 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  57.92 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  58.92 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  57.92 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  57.21 
 
 
416 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  55.7 
 
 
428 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  55.56 
 
 
429 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  38.83 
 
 
436 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  39.95 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  34.53 
 
 
473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  33.77 
 
 
461 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  33.77 
 
 
473 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  33.77 
 
 
473 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  35.9 
 
 
477 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  33.69 
 
 
477 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  35.42 
 
 
477 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  32.56 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  39.64 
 
 
532 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  33.6 
 
 
532 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  33.85 
 
 
531 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  39.64 
 
 
532 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  37.5 
 
 
532 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  31.4 
 
 
477 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  38.61 
 
 
531 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  39.35 
 
 
532 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  39.35 
 
 
532 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  39.35 
 
 
532 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  39.35 
 
 
532 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  39.35 
 
 
532 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  36.65 
 
 
532 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  36.49 
 
 
532 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  36.49 
 
 
532 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  36.21 
 
 
532 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  29.44 
 
 
476 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>