24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0162 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  82.73 
 
 		 110 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  77.98 
 
 		 114 aa  169  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  78.85 
 
 		 106 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  75.73 
 
 		 106 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  72.38 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  72.38 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  69.52 
 
 		 106 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  42.16 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  42.16 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  39.81 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0871  type IV secretory pathway VirB3 family protein  37.11 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  31.18 
 
 		 922 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  31.73 
 
 		 924 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2442  type IV secretory pathway VirB3 family protein  39.08 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.79385 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  40 
 
 		 916 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  31 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  30.77 
 
 		 915 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  32.11 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  34.94 
 
 		 915 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5087  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.35 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0676  type IV secretory pathway VirB3 family protein  34.31 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4377  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  35 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4178  type IV secretory pathway, VirB3-like  29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>