24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0256 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  100 
 
 		 112 aa  229  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  66.96 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5087  type IV secretory pathway VirB3 family protein  62.5 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0676  type IV secretory pathway VirB3 family protein  63.21 
 
 		 113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4377  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  45.37 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5008  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  39 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118647  normal  0.169253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5815  type IV secretory pathway VirB3 family protein  36.73 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6160  type IV secretion system protein VirB3  35 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0419934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8225  type IV secretion system protein VirB3  31.87 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0152  hypothetical protein  42.03 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0170  hypothetical protein  40.58 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.35 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  31.68 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.11 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0864  type IV secretion system protein VirB3  29.07 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3522  type IV secretion system protein VirB3  29.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  27.72 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  27.72 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  29.7 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  27.62 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  32.29 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  29.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  32.29 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  30.69 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>