20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4347 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5087  type IV secretory pathway VirB3 family protein  78.57 
 
 		 112 aa  196  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0676  type IV secretory pathway VirB3 family protein  69.81 
 
 		 113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  66.96 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4377  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  41.18 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5008  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  41.05 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118647  normal  0.169253 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8225  type IV secretion system protein VirB3  35.16 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6160  type IV secretion system protein VirB3  32.38 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0419934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5815  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.71 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  31 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  27.52 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  31.68 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3522  type IV secretion system protein VirB3  31.58 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.43 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  26.73 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  26.73 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  28.71 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  30.3 
 
 		 924 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  26.73 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  29.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>