27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4377 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4377  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  100 
 
 		 109 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  45.37 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5087  type IV secretory pathway VirB3 family protein  43.14 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  41.18 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0676  type IV secretory pathway VirB3 family protein  40.38 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5008  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  46.3 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118647  normal  0.169253 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8225  type IV secretion system protein VirB3  35.79 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6160  type IV secretion system protein VirB3  40.22 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0419934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  37.62 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3522  type IV secretion system protein VirB3  34.38 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  36.63 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  35.64 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  33.33 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  29.81 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  31.88 
 
 		 922 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  33.66 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  33.66 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4446  type IV secretory pathway, VirB3-like  31.82 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.593094  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  31.68 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  31 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  31.91 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  31.91 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  28.79 
 
 		 924 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4178  type IV secretory pathway, VirB3-like  31.58 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  31.25 
 
 		 915 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0864  type IV secretion system protein VirB3  31.76 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4563  type IV secretory pathway VirB3 family protein  29.47 
 
 		 99 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>