21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4201 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  93.4 
 
 		 106 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  92.45 
 
 		 112 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  71.7 
 
 		 110 aa  157  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  71.43 
 
 		 106 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  70.48 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  69.52 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  69.52 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  49.02 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  49.02 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  42.72 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0871  type IV secretory pathway VirB3 family protein  41 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  33.67 
 
 		 915 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  30.48 
 
 		 924 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  34.18 
 
 		 922 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  31.58 
 
 		 916 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2442  type IV secretory pathway VirB3 family protein  34.12 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.79385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1136  type IV secretory pathway VirB3 family protein  34 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  27.62 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.42 
 
 		 915 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  26.73 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>