18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2442 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2442  type IV secretory pathway VirB3 family protein  100 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.79385 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  49.32 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  40 
 
 		 922 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  44.29 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  44.29 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  45.59 
 
 		 915 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  36.73 
 
 		 924 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  38.64 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  39.08 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  35.23 
 
 		 915 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  34.48 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  34.48 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  33.33 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  34.12 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  37.5 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  43.14 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  32.61 
 
 		 916 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0871  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32.18 
 
 		 110 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>