31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6452 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6452  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  42.37 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  31.09 
 
 		 428 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  41.67 
 
 		 700 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  31.65 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  34.23 
 
 		 290 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  31.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  28.57 
 
 		 262 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  32.73 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  35.62 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.61 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  30.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  28.79 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.22 
 
 		 313 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  26.13 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0518  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  26.92 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  28.32 
 
 		 307 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 364 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 364 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  33.82 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  35.14 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  29.23 
 
 		 278 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  29.23 
 
 		 278 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  29.23 
 
 		 278 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  29.23 
 
 		 278 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.23 
 
 		 278 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  46.15 
 
 		 396 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>