58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0173 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0173  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000014605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  20 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  20 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  23.28 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  21.94 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.43 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  21.62 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  22.63 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  26.02 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  21.84 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  20.21 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  21.99 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  21.36 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  21.36 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  19.47 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  23.83 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  19.84 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  19.92 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  17.87 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  20.08 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  23.41 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  18.35 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  16.99 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  23.56 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  21.39 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  20.45 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.58 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  22.39 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  19.89 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  19.47 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  17.46 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  21.47 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  19.61 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  25.23 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  21.14 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25.76 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  21.9 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  18.57 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  23.5 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  19.62 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  19.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  28.77 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  21.19 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  20.86 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  20.42 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  16.73 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  36 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  31.08 
 
 		 225 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  31.08 
 
 		 225 aa  42  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>