182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0731 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0731  tRNA-Tyr  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  94 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  92.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  92.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  92.73 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  92 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  93.48 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  93.48 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
83 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  93.75 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21440  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000199792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  91.3 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  91.3 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
86 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  96.77 
 
 
82 bp  54  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
82 bp  54  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
85 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
82 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
82 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
82 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
85 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  89.36 
 
 
85 bp  54  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
82 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  85.71 
 
 
85 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  86.21 
 
 
82 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00104737  normal  0.145686 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  86.21 
 
 
87 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0163421  hitchhiker  0.00837665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  86.21 
 
 
85 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  84.38 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.582085  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0010  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.29414e-23  normal  0.0775658 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  84.13 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2055  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  86.44 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309331  unclonable  0.0000000000000213015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0041  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  86.44 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  87.23 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09740  tRNA-Tyr  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000943193  hitchhiker  0.0000123318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  87.23 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0876919  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0340813  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  84.13 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  88.37 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0203924  normal  0.277974 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.411326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>