15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0321 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0321  amino acid or sugar ABC transport systems, permease protein  100 
 
 
268 aa  503  9.999999999999999e-143  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000115893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  24.45 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  25.33 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  26.22 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  22.88 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  24.56 
 
 
346 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  24.8 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  24.79 
 
 
425 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  22.27 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
418 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  23.13 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  25.85 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3538  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0954  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  19.93 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.626915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>