273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0954 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0954  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 278 aa  537  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  27.1 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  26.81 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  26.97 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  28 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.11 
 
 		 425 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  26.28 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  25.18 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  28.72 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  25.81 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  25.35 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  26.28 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  25.09 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  25.8 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  26.35 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  23.53 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  26.35 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  26.35 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  25.61 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  27.17 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  26.13 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  27.47 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  25.17 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  24.75 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  24.83 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  23.96 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  24.19 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  25.64 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  23.96 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  24.46 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5656  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.44 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  25.3 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  25.35 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  24.1 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  25.74 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  24.33 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  25.75 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  25.69 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  23.38 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  25 
 
 		 319 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  25.86 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  24.39 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.62 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  25.18 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  24.04 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  25.81 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  25.96 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  22.73 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  24.91 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  25 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  28.27 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>