40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2801 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  96.3 
 
 
108 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  87.04 
 
 
108 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  87.96 
 
 
108 aa  191  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  87.04 
 
 
108 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  87.04 
 
 
108 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  86.11 
 
 
108 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  61.11 
 
 
108 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  61.11 
 
 
108 aa  121  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  55.41 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  33.66 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  36.46 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  35.42 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  35.29 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0059  hypothetical protein  32.26 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  26.53 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  42.59 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  42.59 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  33.78 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  42.59 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  27.96 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  40.74 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0113  hypothetical protein  38.33 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  26.39 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  26.39 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  26.39 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  26.39 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0084  hypothetical protein  34.29 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  29.23 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  29.23 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>