34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3626 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  47.47 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  45.57 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  40.79 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  39.68 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  36.92 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  36.76 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  36.05 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  31.19 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  34.85 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  34.85 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0324  hypothetical protein  40.74 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  29.23 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  31.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  29.23 
 
 		 108 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  31.48 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>