43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0442 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  77.78 
 
 
108 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  67.59 
 
 
108 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  67.59 
 
 
108 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  95.95 
 
 
74 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  63.39 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  61.11 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  42.39 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  37.36 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  44.29 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0059  hypothetical protein  36.67 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  34.72 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  42.25 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  42.25 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  42.25 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  40.85 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0084  hypothetical protein  32.22 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  29.13 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0324  hypothetical protein  29.36 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0180  hypothetical protein  32.86 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0186  hypothetical protein  29.36 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180112  normal  0.878159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0113  hypothetical protein  36.11 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3056  hypothetical protein  51.35 
 
 
719 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  31 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  31 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>