22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0324 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0324  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0186  hypothetical protein  80.67 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180112  normal  0.878159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0180  hypothetical protein  80.67 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0059  hypothetical protein  55.95 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0084  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  27.93 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  32.22 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  27.16 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  25.93 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  40.74 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  40.74 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  29.76 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>