44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3766 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  38.58 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  41.51 
 
 
128 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  40.57 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  40.57 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  40.18 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  38.14 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  37.72 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  37.72 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  37.72 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  39.58 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  42.47 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  39.39 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  44.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  43.84 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  43.84 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  43.84 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  43.84 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  42.03 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  34.38 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0324  hypothetical protein  37.84 
 
 
119 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0180  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0186  hypothetical protein  38.1 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180112  normal  0.878159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0059  hypothetical protein  34.43 
 
 
122 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  44.19 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  38.67 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0084  hypothetical protein  31.94 
 
 
122 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  44.68 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  44.68 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  41.3 
 
 
107 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  41.3 
 
 
107 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>