51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0252 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  223  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  58.56 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  47.47 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  47.47 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  41.56 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  35.63 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  44.64 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  41.03 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  36.76 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  35.48 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  40.58 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  32.1 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  30.93 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  36.05 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  35.42 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  39.68 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  34.94 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  29.13 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  32.58 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  32.58 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  37.35 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  34.18 
 
 
107 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  38.18 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  37.97 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  37.97 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  36.23 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  32.91 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  31.82 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  36.71 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  32.5 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  32.5 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  32.5 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  34.18 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  34.18 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  28.05 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4184  hypothetical protein  38.33 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  34.18 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  34.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0995  hypothetical protein  39.62 
 
 
106 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>