40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2939 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  219  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  85.19 
 
 		 108 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  63.89 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  63.89 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  55.41 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  32.67 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  34.38 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  35.29 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0059  hypothetical protein  32.26 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  33.78 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  29 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  29 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0113  hypothetical protein  38.33 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  26.39 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  26.39 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  26.39 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0084  hypothetical protein  34.29 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  34.33 
 
 		 113 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  26.39 
 
 		 124 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>