37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0468 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  44.34 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  43.4 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  43.4 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  43.1 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  35.34 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  40.18 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  34.48 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  51.32 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  43.68 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  42.53 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  37.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  33.91 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  40.85 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  38.03 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  39.71 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  38.1 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  34.72 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  34.72 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  34.72 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  34.72 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  34.72 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  44.64 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  33.7 
 
 
108 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  34.74 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  35.42 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  34.38 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  37.93 
 
 
112 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  40.91 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>