35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4913 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  96.85 
 
 		 127 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  83.05 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  83.61 
 
 		 124 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  83.61 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  83.61 
 
 		 124 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  79.03 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  62.39 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  56.73 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  55.77 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  55.77 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  55.77 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  38.58 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  43.68 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  37.19 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  31.51 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  26.53 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  32.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  29 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  26.39 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  26.39 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  26.39 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  26.39 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>