36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0549 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  200  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  57 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  53.42 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  52.05 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  52.05 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  52.05 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  45.95 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  46.03 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  41.1 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  41.1 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  46.03 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  41.1 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  41.56 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  36.99 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  39.51 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  39.68 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  39.68 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  39.51 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  36.47 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  40.58 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  38.03 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  38.67 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  40.38 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  32.31 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>