30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0113 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2899  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0215  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2274  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2889  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6232  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0415  hypothetical protein  38.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0625826  normal  0.107838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0291324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2939  hypothetical protein  38.33 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2801  hypothetical protein  38.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  46.81 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  47.83 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  48.08 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0462  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.910205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0442  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1085  hypothetical protein  33.63 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2647  hypothetical protein  41.67 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3188  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1373  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0220  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1703  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4184  hypothetical protein  37.18 
 
 		 112 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  45.95 
 
 		 101 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0257784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>